Riadiacim orgánom tohto operačného programu je Ministerstvo školstva SR a sprostredkovateľským orgánom pod riadiacim orgánom je Agentúra Ministerstva školstva pre štrukturálne fondy EÚ. V rámci operačného programu výskum a vývoj boli navrhnuté štyri prioritné osi.
Hlavnou oblasťou podpory tohto operačného programu je podpora výskumu a vývoja, primárne modernizácia a zefektívnenie systému a skvalitnenie infraštruktúry vysokých škôl tak, aby prispievali k zvyšovaniu konkurencieschopnosti ekonomiky, znižovaniu regionálnych disparít, vzniku nových inovatívnych (high-tech) malých a stredných podnikov, tvorbe nových pracovných miest a zlepšeniu podmienok vzdelávacieho procesu na vysokých školách.
K podporovaným aktivitám budú patriť:
· obnova a budovanie technickej infraštruktúry výskumu a vývoj
· podpora sietí excelentných pracovísk výskumu a vývoja ako pilierov rozvoja regiónu,
· podpora nadregionálnej spolupráce
· prenos poznatkov a technológií získaných výskumom a vývojom do praxe
· rozvoj budovania infraštruktúry vysokých škôl a modernizácia ich vnútorného vybavenia za účelom zlepšenia podmienok vzdelávacieho procesu (iba pre žiadateľov mimo Bratislavského samosprávneho kraja)